因?yàn)闆]有大案辦理的夏洛克又陷入了無聊之中，非常想吸煙但約翰不許。正在夏洛克快要癲狂的時(shí)候，有一個(gè)叫亨利的年輕人來找他幫忙，夏洛克一如既往一眼就看出亨利是因?yàn)樽蛲戆l(fā)生了什么時(shí)而搭今天早上第一班火車來找他幫忙。事實(shí)上，亨利來自巴斯克維爾地區(qū)，在那里有一個(gè)軍事基地一直被外界懷疑為在進(jìn)行生化研究，外界人士揣測(cè)有一些改造基因動(dòng)物被研究出來并且可能已經(jīng)到了外面的世界。亨利小時(shí)候目睹了自己父親死亡的經(jīng)過，他認(rèn)為是一條被人為改造了基因的獵犬殺死了他的父親。夏洛克本來認(rèn)為這是由于亨利的童年陰影造成的記憶扭曲而深感無聊準(zhǔn)備送客，但卻突然改變主意要親自去巴斯克維爾破解這個(gè)獵犬之謎。　　來到巴斯克維爾的夏洛克發(fā)現(xiàn)，當(dāng)?shù)厝硕荚谡務(wù)撽P(guān)于巨型獵犬的話題，而且因?yàn)檫@個(gè)謎題而吸引了大批的旅客來到這個(gè)小鎮(zhèn)，夏洛克從一個(gè)到處攬客的當(dāng)?shù)貙?dǎo)游那里得到了一些關(guān)于巨型獵犬的信息。另一方面亨利一直在進(jìn)行心理治療但卻沒什么進(jìn)展，但他新的治療卻讓他反復(fù)想起兩個(gè)單詞，自由（liberty）和里面（in）?！　∠穆蹇擞脧乃绺邕~克羅夫特哪里偷來的證件進(jìn)入了巴斯克維爾的軍事基地探查情況，但并沒有發(fā)現(xiàn)可疑的東西，不過機(jī)緣巧合發(fā)現(xiàn)了曾經(jīng)向夏洛克發(fā)郵件求助尋找失蹤兔子的小女孩的媽媽斯泰普頓是這個(gè)基地的一個(gè)研究員，由此夏洛克知道了這個(gè)基地確實(shí)在做一些基因工程方面的研究。夏洛克差點(diǎn)被發(fā)現(xiàn)是冒充的，一位弗蘭克蘭德博士替他們掩飾過去，博士聲稱自己是亨利父親生前的好友，是夏洛克的粉絲并且答應(yīng)可以向夏洛克提供幫助?！　∠穆蹇撕图s翰去了亨利的家中，要亨利晚上與他們一起再回一次他父親遇害的山谷，約翰看到對(duì)面山谷上有燈光一閃一閃的很像摩爾斯電碼于是停下來查看，結(jié)果落在了夏洛克他們的后面。夏洛克與亨利到了充滿霧氣的山谷，果然巨型獵犬出現(xiàn)了，亨利被嚇壞了但夏洛克卻說自己并沒有看到匆匆離開。　　約翰在旅店的大廳里找到了坐在火爐旁邊的夏洛克，夏洛克承認(rèn)自己看到了巨型獵犬并且自己感到恐懼，雖然恐懼但夏洛克的頭腦依然很清晰，在談話中夏洛克說自己沒有朋友（friends），約翰因此而感到有些失望。亨利的精神狀況越來越差，John獨(dú)自去查摩爾斯電碼的時(shí)候發(fā)現(xiàn)燈光是妓女的車燈，這時(shí)夏洛克要約翰去跟亨利的心理醫(yī)生莫蒂梅爾談話，想要從她那里得到一些關(guān)于亨利的問題，但卻被弗蘭克蘭德博士打斷了?！　∠穆蹇瞬煊X到了約翰的情緒問題，向他解釋說自己確實(shí)沒有朋友（friends）因?yàn)樗挥幸粋€(gè)朋友（friend），并且親手泡了咖啡看著約翰喝完。這時(shí)約翰看到了被邁克羅夫特派來“休假”的雷斯垂德(魯珀特·格雷夫斯 飾)警官，約翰要雷斯垂德警官幫忙調(diào)查一個(gè)素食餐館，因?yàn)樗谶@個(gè)餐館發(fā)現(xiàn)了大量的肉類訂單，結(jié)果發(fā)現(xiàn)這個(gè)餐館偷偷養(yǎng)了一條大狗到處留下腳印冒充被改造過基因的巨型獵犬的腳印用以招攬游客，不過大狗已經(jīng)死了。　　夏洛克和約翰在邁克羅夫特的幫助下再次進(jìn)入了巴斯克維爾的軍事基地，夏洛克k去找少校，讓約翰在基地中檢查，約翰進(jìn)入一個(gè)房間之后被鎖在了里面，隨后斷了電，他發(fā)現(xiàn)有幾個(gè)空的籠子在這間房子里，而且其中一個(gè)有什么東西逃出來的痕跡，他似乎聽到了大獵犬的喘息聲，于是躲進(jìn)了籠子，并打電話給夏洛克說自己看到了巨型獵犬就如他所說的那樣，通體發(fā)光。夏洛克趕到了屋子里卻什么也沒有。其實(shí)這是夏洛克安排的一次實(shí)驗(yàn)，他讓約翰看到了他想讓他看到的東西，因?yàn)橄穆蹇丝吹降墨C犬并沒有通體發(fā)光，而他告訴約翰說會(huì)發(fā)光，結(jié)果約翰就看到了發(fā)光的獵犬，夏洛克于是進(jìn)入了自己的記憶宮殿尋找答案。這時(shí)在進(jìn)行心理治療的亨利向自己的治療師開了槍，所幸并沒有打中，但亨利卻被自己嚇了一跳，跑了出去?！　∵€在軍事基地的夏洛克推理出了少校的密碼，從而進(jìn)入了秘密檔案，以魔犬（HOUND)為關(guān)鍵詞發(fā)現(xiàn)了一些20年前做實(shí)驗(yàn)的資料。夏洛克在山谷里及時(shí)阻止了想要開槍自殺的亨利，巨型獵犬再一次出現(xiàn)被雷斯垂德警官和約翰開槍射中現(xiàn)出原形，那只是一條普通的狗。原來這一切都是弗蘭克蘭德博士搞的鬼，他一直在進(jìn)行一種藥物試驗(yàn)，那種藥可以使人產(chǎn)生恐懼和刺激，并且產(chǎn)生幻覺。這種要通過氣溶性擴(kuò)散就隱藏在山谷的霧中。弗蘭克蘭德博士趁亂逃走了但卻不小心走進(jìn)了地雷區(qū)，踩到了地雷。